Làm thế nào các siêu máy tính đang được sử dụng để giành chiến thắng trong cuộc chiến chống lại coronavirus
Những nỗ lực khoa học để phân tích, lập bản đồ và theo dõi sự bùng phát COVID -19 toàn cầu đang được hỗ trợ bởi các siêu máy tính mạnh mẽ mà các nhà khoa học cho rằng có thể sớm giúp chống lại căn bệnh truyền nhiễm.
Theo thống kê của Đại học Johns Hopkins, các máy tính có khả năng ăn và xử lý một lượng lớn dữ liệu thô đang xuất hiện cùng với mục đích hiểu rõ hơn về loại coronavirus mới hiện đã lây lan đến ít nhất 582.000 người ở Mỹ và gần hai triệu người trên toàn cầu.
Nga lên kế hoạch cho các siêu máy tính mới khi công nghệ tụt hậu so với Mỹ và Trung QuốcĐỌC THÊM
Tháng trước, Nhà Trắng đã công bố Hiệp hội điện toán hiệu suất cao COVID -19 - một loại cocktail của các đại gia công nghệ, cơ quan liên bang và học viện bao gồm IBM, Amazon Web Services, Microsoft, Viện Công nghệ Massachusetts (MIT), NASA, Google, HP và hơn.
Tập thể, dựa trên các hệ thống siêu máy tính từ năm phòng thí nghiệm của Bộ năng lượng quốc gia Hoa Kỳ, hiện có ít nhất 17 dự án đang hoạt động , sử dụng máy móc để giảm triệt để thời gian cần thiết cho khoa học và nghiên cứu, mà các chuyên gia cho biết bao gồm dịch tễ học và mô hình hóa phân tử.
"Những thí nghiệm này sẽ mất nhiều năm để hoàn thành nếu làm việc bằng tay hoặc vài tháng nếu xử lý trên các nền tảng điện toán truyền thống chậm hơn", Dario Gil, Giám đốc nghiên cứu của IBM, đã viết trong một bài đăng trên blog trong tháng này chi tiết về cách bộ phận của ông đóng góp cho dự án.
Theo Gil, công trình đã có dấu hiệu hứa hẹn sau khi siêu máy tính của Hội nghị thượng đỉnh được sử dụng bởi các nhà nghiên cứu tại Phòng thí nghiệm quốc gia Oak Ridge và Đại học Tennessee.
"[Các nhà nghiên cứu đã sàng lọc] 8.000 hợp chất để tìm ra những hợp chất có khả năng liên kết với protein 'spike' chính của coronavirus , khiến nó không thể lây nhiễm tế bào chủ", ông lưu ý.
"Họ đã có thể đề xuất 77 hợp chất thuốc phân tử nhỏ đầy hứa hẹn hiện có thể được thử nghiệm. Đây là sức mạnh của việc tăng tốc khám phá thông qua tính toán."
Nvidia cũng vậy, đã xác nhận trong tháng này rằng một nhóm các nhà khoa học máy tính của họ đã tham gia vào nỗ lực nghiên cứu mới, dưới sự lãnh đạo của Ian Buck, phó chủ tịch của công ty Máy tính gia tốc. Các đơn vị xử lý đồ họa NVIDIA ( GPU ) được sử dụng trong nhiều siêu máy tính hàng đầu.
" COVID -19 HPC Consortium là chương trình Apollo của thời đại chúng ta", Buck nói trong một tuyên bố được công bố trên trang web của công ty. "Không phải là một cuộc đua đến mặt trăng, đây là một cuộc đua cho nhân loại. Các tàu tên lửa là siêu máy tính GPU và nhiên liệu của chúng là kiến thức khoa học."
" NVIDIA sẽ giúp đỡ bằng cách làm cho các tên lửa này di chuyển nhanh nhất có thể. Để đạt được tiến bộ cuối cùng sẽ cần kết hợp ba thành phần thiết yếu của các nhà khoa học, nhà khoa học máy tính và máy tính hiệu năng cao. Chúng tôi rất vinh dự được đóng vai trò trong nỗ lực này, "Ông nói thêm.
Sự ra mắt của tập đoàn đã thúc đẩy một làn sóng hoạt động siêu máy tính mới , tất cả dành riêng để giải quyết các câu đố quan trọng của căn bệnh gây ra hơn 119.000 ca tử vong trên toàn cầu.
Tháng này, Trung tâm nghiên cứu khí quyển quốc gia ( NCAR ) cho biết siêu máy tính của nó, đó là một cỗ máy petaflop 5,34 được gọi là "Cheyenne", giờ đây sẽ được sử dụng để giúp nghiên cứu về đại dịch, bao gồm cả mô hình truyền bệnh tiềm năng và liệu nó có bị ảnh hưởng bởi thời vụ không thay đổi.
Cùng tuần đó, các chuyên gia từ Đại học College London ( UCL ) cho biết dữ liệu lớn và siêu máy tính sẽ hữu ích trong việc xác định thuốc kháng vi-rút mới bằng cách sàng lọc các thư viện thuốc tiềm năng, nghiên cứu sự lây lan của vi-rút trong cộng đồng và phân tích cấu trúc của COVID -19.
Dan Stanzione , giám đốc điều hành của Trung tâm điện toán nâng cao Texas, nói với Bloomberg trong tháng này rằng việc sử dụng siêu máy tính có thể giúp ích rất nhiều cho những nỗ lực y tế.
"Về cơ bản, đó là kích thước và tốc độ," ông nói, lưu ý rằng các hệ thống đang chạy hàng chục ngàn mô hình dịch tễ học cùng một lúc, không phải là một khối lượng máy tính bình thường có thể quản lý. Và nhìn về phía trước, Stanzione cho biết họ có thể đóng một vai trò trong việc thu hẹp một loại vắc-xin tiềm năng.
"Cuối cùng, tôi nghĩ rằng điện toán sẽ không phải là nút cổ chai của chúng tôi," ông nói thêm. "Chúng tôi có thể chạy những thứ này khá nhanh, có nhiều hợp chất hóa học khác nhau mà chúng tôi có thể muốn thử."
ĐỌC THÊM
Thử nghiệm trên người về hai loại vắc-xin coronavirus bắt đầu ở Trung Quốc
Amazon phải đối mặt với sự giám sát sau khi sa thải những công nhân chỉ trích COVID -19
Người đàn ông Florida bị bắt vì máy ảnh ho vào cảnh sát trong khi bị bắt
Giáo sư Peter Coveney , thuộc UCL , đã đồng ý rằng kế hoạch siêu máy tính của tập đoàn có thể tăng tốc độ săn lùng các phương pháp điều trị COVID -19 khả thi . Hoặc, ít nhất, gắn cờ một số loại thuốc đầy triển vọng.
"Đây là một cách nhanh chóng hơn nhiều để tìm ra phương pháp điều trị phù hợp hơn quá trình phát triển thuốc điển hình", giáo sư Coveney xây dựng trong một tuyên bố. "Thông thường, các công ty dược phẩm phải mất 12 năm và 2 tỷ đô la để đưa một loại thuốc từ khám phá ra thị trường, nhưng chúng tôi đang viết lại các quy tắc bằng cách sử dụng các máy tính mạnh mẽ để tìm kim trong đống cỏ khô trong một phần nhỏ thời gian và chi phí đó."
Stanzione thừa nhận rằng sức mạnh tính toán dường như không phải là một vấn đề, nhưng lưu ý rằng có những giới hạn cho công việc. Ông nói với Bloomberg : "Thực sự, những gì máy tính làm là giúp giảm số lượng những thứ chúng ta cần thử trong phòng thí nghiệm. Cuối cùng, đối với vắc-xin [chúng tôi] ngược dòng những gì các nhà hóa học y tế làm."
"Tất cả những gì chúng ta có thể làm là nói, trong số mười đến 60 hợp chất hóa học có thể có trong vũ trụ, đây là một tập hợp rất lớn mà chúng ta biết sẽ không hoạt động, đây có thể là vài chục ứng cử viên để thử. Nhưng họ vẫn sẽ phải trải qua các thử nghiệm lâm sàng ", ông nói thêm. "Đó là nơi vẫn còn rất nhiều thời gian."
Theo thống kê của Đại học Johns Hopkins, các máy tính có khả năng ăn và xử lý một lượng lớn dữ liệu thô đang xuất hiện cùng với mục đích hiểu rõ hơn về loại coronavirus mới hiện đã lây lan đến ít nhất 582.000 người ở Mỹ và gần hai triệu người trên toàn cầu.
Nga lên kế hoạch cho các siêu máy tính mới khi công nghệ tụt hậu so với Mỹ và Trung QuốcĐỌC THÊM
Tháng trước, Nhà Trắng đã công bố Hiệp hội điện toán hiệu suất cao COVID -19 - một loại cocktail của các đại gia công nghệ, cơ quan liên bang và học viện bao gồm IBM, Amazon Web Services, Microsoft, Viện Công nghệ Massachusetts (MIT), NASA, Google, HP và hơn.
Tập thể, dựa trên các hệ thống siêu máy tính từ năm phòng thí nghiệm của Bộ năng lượng quốc gia Hoa Kỳ, hiện có ít nhất 17 dự án đang hoạt động , sử dụng máy móc để giảm triệt để thời gian cần thiết cho khoa học và nghiên cứu, mà các chuyên gia cho biết bao gồm dịch tễ học và mô hình hóa phân tử.
"Những thí nghiệm này sẽ mất nhiều năm để hoàn thành nếu làm việc bằng tay hoặc vài tháng nếu xử lý trên các nền tảng điện toán truyền thống chậm hơn", Dario Gil, Giám đốc nghiên cứu của IBM, đã viết trong một bài đăng trên blog trong tháng này chi tiết về cách bộ phận của ông đóng góp cho dự án.
Theo Gil, công trình đã có dấu hiệu hứa hẹn sau khi siêu máy tính của Hội nghị thượng đỉnh được sử dụng bởi các nhà nghiên cứu tại Phòng thí nghiệm quốc gia Oak Ridge và Đại học Tennessee.
"[Các nhà nghiên cứu đã sàng lọc] 8.000 hợp chất để tìm ra những hợp chất có khả năng liên kết với protein 'spike' chính của coronavirus , khiến nó không thể lây nhiễm tế bào chủ", ông lưu ý.
"Họ đã có thể đề xuất 77 hợp chất thuốc phân tử nhỏ đầy hứa hẹn hiện có thể được thử nghiệm. Đây là sức mạnh của việc tăng tốc khám phá thông qua tính toán."
Nvidia cũng vậy, đã xác nhận trong tháng này rằng một nhóm các nhà khoa học máy tính của họ đã tham gia vào nỗ lực nghiên cứu mới, dưới sự lãnh đạo của Ian Buck, phó chủ tịch của công ty Máy tính gia tốc. Các đơn vị xử lý đồ họa NVIDIA ( GPU ) được sử dụng trong nhiều siêu máy tính hàng đầu.
" COVID -19 HPC Consortium là chương trình Apollo của thời đại chúng ta", Buck nói trong một tuyên bố được công bố trên trang web của công ty. "Không phải là một cuộc đua đến mặt trăng, đây là một cuộc đua cho nhân loại. Các tàu tên lửa là siêu máy tính GPU và nhiên liệu của chúng là kiến thức khoa học."
" NVIDIA sẽ giúp đỡ bằng cách làm cho các tên lửa này di chuyển nhanh nhất có thể. Để đạt được tiến bộ cuối cùng sẽ cần kết hợp ba thành phần thiết yếu của các nhà khoa học, nhà khoa học máy tính và máy tính hiệu năng cao. Chúng tôi rất vinh dự được đóng vai trò trong nỗ lực này, "Ông nói thêm.
Sự ra mắt của tập đoàn đã thúc đẩy một làn sóng hoạt động siêu máy tính mới , tất cả dành riêng để giải quyết các câu đố quan trọng của căn bệnh gây ra hơn 119.000 ca tử vong trên toàn cầu.
Tháng này, Trung tâm nghiên cứu khí quyển quốc gia ( NCAR ) cho biết siêu máy tính của nó, đó là một cỗ máy petaflop 5,34 được gọi là "Cheyenne", giờ đây sẽ được sử dụng để giúp nghiên cứu về đại dịch, bao gồm cả mô hình truyền bệnh tiềm năng và liệu nó có bị ảnh hưởng bởi thời vụ không thay đổi.
Cùng tuần đó, các chuyên gia từ Đại học College London ( UCL ) cho biết dữ liệu lớn và siêu máy tính sẽ hữu ích trong việc xác định thuốc kháng vi-rút mới bằng cách sàng lọc các thư viện thuốc tiềm năng, nghiên cứu sự lây lan của vi-rút trong cộng đồng và phân tích cấu trúc của COVID -19.
Dan Stanzione , giám đốc điều hành của Trung tâm điện toán nâng cao Texas, nói với Bloomberg trong tháng này rằng việc sử dụng siêu máy tính có thể giúp ích rất nhiều cho những nỗ lực y tế.
"Về cơ bản, đó là kích thước và tốc độ," ông nói, lưu ý rằng các hệ thống đang chạy hàng chục ngàn mô hình dịch tễ học cùng một lúc, không phải là một khối lượng máy tính bình thường có thể quản lý. Và nhìn về phía trước, Stanzione cho biết họ có thể đóng một vai trò trong việc thu hẹp một loại vắc-xin tiềm năng.
"Cuối cùng, tôi nghĩ rằng điện toán sẽ không phải là nút cổ chai của chúng tôi," ông nói thêm. "Chúng tôi có thể chạy những thứ này khá nhanh, có nhiều hợp chất hóa học khác nhau mà chúng tôi có thể muốn thử."
ĐỌC THÊM
Thử nghiệm trên người về hai loại vắc-xin coronavirus bắt đầu ở Trung Quốc
Amazon phải đối mặt với sự giám sát sau khi sa thải những công nhân chỉ trích COVID -19
Người đàn ông Florida bị bắt vì máy ảnh ho vào cảnh sát trong khi bị bắt
Giáo sư Peter Coveney , thuộc UCL , đã đồng ý rằng kế hoạch siêu máy tính của tập đoàn có thể tăng tốc độ săn lùng các phương pháp điều trị COVID -19 khả thi . Hoặc, ít nhất, gắn cờ một số loại thuốc đầy triển vọng.
"Đây là một cách nhanh chóng hơn nhiều để tìm ra phương pháp điều trị phù hợp hơn quá trình phát triển thuốc điển hình", giáo sư Coveney xây dựng trong một tuyên bố. "Thông thường, các công ty dược phẩm phải mất 12 năm và 2 tỷ đô la để đưa một loại thuốc từ khám phá ra thị trường, nhưng chúng tôi đang viết lại các quy tắc bằng cách sử dụng các máy tính mạnh mẽ để tìm kim trong đống cỏ khô trong một phần nhỏ thời gian và chi phí đó."
Stanzione thừa nhận rằng sức mạnh tính toán dường như không phải là một vấn đề, nhưng lưu ý rằng có những giới hạn cho công việc. Ông nói với Bloomberg : "Thực sự, những gì máy tính làm là giúp giảm số lượng những thứ chúng ta cần thử trong phòng thí nghiệm. Cuối cùng, đối với vắc-xin [chúng tôi] ngược dòng những gì các nhà hóa học y tế làm."
"Tất cả những gì chúng ta có thể làm là nói, trong số mười đến 60 hợp chất hóa học có thể có trong vũ trụ, đây là một tập hợp rất lớn mà chúng ta biết sẽ không hoạt động, đây có thể là vài chục ứng cử viên để thử. Nhưng họ vẫn sẽ phải trải qua các thử nghiệm lâm sàng ", ông nói thêm. "Đó là nơi vẫn còn rất nhiều thời gian."
Nhận xét
Đăng nhận xét